Perfil taxonomico de microbiomas bacterianos con la secuenciación shotgun presentes en la captación Chimu y bahía interna del Lago Titicaca, Puno, Perú, 2023

Abstract

El Lago Titicaca, ubicado a una altura de 3,825 metros sobre el nivel del mar y reconocido como el lago navegable más extenso (8000 km2) y alto del mundo; es un ecosistema de agua dulce expuesto a contaminación permanente, por lo tanto, es de vital importancia conocer la presencia y diversidad de las comunidades bacterianas que mantienen el equilibrio ecológico, y que a la fecha aún no han sido estudiadas. En tal razón, se planteó como objetivo de trabajo determinar el perfil taxonómico de microbiomas bacterianos mediante la secuenciación Shotgun en la captación Chimu y Bahía Interna del Lago Titicaca. La metodología empleada fue de tipo observacional y descriptivo. Se recolectaron muestras de agua, con cinco repeticiones cada una. Posteriormente, se procedió a la extracción y evaluación de la cantidad, calidad e integridad del DNA genómico bacteriano de cada una de las muestras obtenidas y enviadas a -80°C a BTSconsultores para la construcción de librerías de los genomas completos por la secuenciación Shotgun. Los resultados muestran que en la Bahía Interna al clado más representativo son las Alphaproteobacterias, con la especie Alphaproteobacterium SCGC AAA028 D10. En la captación Chimu, el clado con mayor representatividad son las Actinomicetas, con la especie Candidatus nanopelagicus abundans. En conclusión, se obtuvo el árbol filogenético de la Bahía Interna y la captación Chimu resaltando la presencia de Alpha proteobacterium SCGC AAA028 D10, como especie representativa en los dos árboles filogenéticos; y según el mapa de calor, Alpha proteobacterium SCGC AAA028 D10 presenta la abundancia relativa más alta para ambas zonas de estudio.